За 20 лет в буржуазной Эстонии получило высшее образование около 300 агрономов и 220 ветеринарных врачей. При Советской власти только за 14 лет своего существования Эстонская сельскохозяйственная академия выпустила свыше 1 тыс. агрономов и 550 ветеринарных врачей. Центром научной работы в республике является Академия наук Эстонской ССР, основанная в 194(5 г. В составе Академии наук 3 отделения — физико-технических и математических наук, химико-технологическнх и биологических наук, общественных наук. Этим отделениям подчиняются свыше 20 научно-исследовательских институтов, лабораторий, опытных баз и музеев. В научно-исследовательских институтах изучаются многие проблемы физики, химии, кибернетики, а также такие теоретические проблемы, как фотосинтез, физика люминесценции кристаллов.

Много сделано по исследованию химической природы горючих сланцев, получению продуктов их переработки и использованию их в народном хозяйстве. Свой вклад в дело изучения природы Эстонии, ее хозяйственных проблем вносит Эстонское географическое общество при Академии наук ЭССР. Оно занимается не только научными исследованиями, по и пропагандой географических знаний (например, издает литературу для туристов и краеведов). В Эстонии более 80 научных учреждений, а число научных сотрудников, включая тех, кто работает в высших учебных заведениях, превышает 3300. По сравнению с 1940 г. число научных учреждений увеличилось почти в 3,5 раза, а научных работников — почти в 6 раз.