По мощности они лишь немного уступали таллинским. Укрепления сильно пострадали в войнах XVI—XVIII вв. и были почти полностью снесены в XVIII в. Уцелели лишь незначительные части стены на западной стороне, близ улицы Кингисеппа, на восточной стороне вдоль реки и на северо-западной стороне, в садах, расположенных вдоль улицы Мичурина. Наше представление о городских укреплениях Тарту дополняют изображения на планах города, хранящиеся в Военном архиве в Стокгольме, из них в первую очередь планы 1636 и 1683 гг. Важные данные содержатся в очень детальных описаниях города, составленных польскими властями в 1590 и 1616 гг. Однако на основании этих данных невозможно реконструировать полностью оборонительную систему: неясным остается вопрос об отдельных этапах в сооружении городских укреплений. Данные о числе башен и ворот противоречивы, невозможно установить и средневековые названия башен. Совершенно ясно все же, что здесь, как и в Таллине, в течение всего средневекового периода происходили работы по перестройке городских укреплений и по их приспособлению к беспрерывно усовершенствовавшимся приемам военной техники.

По поводу тартуских укреплений необходимо обратить внимание еще на одно обстоятельство. Исследователи утверждали, что все показанные на планах XVII в. башни и прясла городской стены сооружены немцами в средине века. Однако этот взгляд следует считать ошибочным. Данные упомянутых выше польских описаний города 1590 и 1616 гг. совершенно недвусмысленно указывают на то, Что значительная часть городской стены (равно как и замок епископа) были реконструированы и усилены во время Ливонской войны русскими, построившими также ряд новых и перестроившими несколько старых башен.