Начиная с первых десятилетий XV в. эти города самовластно хозяйничают в новгородской конторе, и, несмотря на протесты и противодействия западных ганзейских городов, эта контора делается фактически филиалом ливонских городов. Ганза в конце концов была вынуждена издать приказ о том, чтобы новгородская контора следовала распоряжениям Таллина и Тарту. Эта руководящая роль была очень выгодна: города Ливонии могли в своих интересах заключать договоры и сделки, объявлять запрещение ввоза и вывоза товаров в зависимости от того, насколько это было выгодно именно этим ведущим ливонским городам. Словом, Тарту и Таллин старались руководить русской торговлей так, чтобы извлечь из нее максимальную прибыль для себя, не считаясь с интересами далеких западных ганзейских городов. Очень большие прибыли города Прибалтики получили и благодаря праву организовывать складочные места (штапели).

Большое значение в XV и XVI вв. имело развитие ремесла, рост товарно-денежных отношений, а в особенности — расширение внутренней торговли, которая в XV в. сделалась для горожан одним из самых важных источников обогащения. Росту экономической мощи способствовало и увеличение политического влияния городов. Большое значение приобрели совещания городов, которые возникли уже в середине XIV в. В XV в. города начали играть большую роль и на ландтагах, где представители городской олигархии выступали в качестве равноправного сословия наряду с ландесгеррами и рыцарством. Для того чтобы содействовать усилению эксплуатации и подавлению классовой борьбы, кроме массового закрепощения крестьян, в начале XV в. приступили и к религиозному наступлению на них.