Разнообразие почв Эстонии объясняется неоднородностью материнских пород, различием водного режима местности, а также ее геологическим развитием. Например, на низменных участках, которые относительно недавно были покрыты водами при- ледниковых морей и Балтийского моря, процесс почвообразования начался позже, чем на возвышенностях. Так как Эстония находится в зоне умеренного климата, то наиболее распространены здесь дерново-подзолистые почвы смешанных лесов. В северной и северо-западной частях, а также на островах Сарема и Хнума распространены дерново-карбонатные типичные (рихковые) и заболоченные почвы, образовавшиеся на щебенчатой и завалупенной карбонатной морене. Типичные дерново-карбонатные почвы содержат известняковый щебень и из-за грубого механического состава плохо удерживают влагу. В засушливые годы растительность на них быстро выгорает.

На таких почвах обычно сеют рожь, ячмень, а также картофель, люцерну, белый донник. Распространенные в северной Эстонии заболоченные дерново-глеевые почвы при условии осушения благоприятны для выращивания овощей и корнеплодов. Лучшие почвы — выщелоченные карбонатные — занимают возвышенность Пандивере и центральную часть республики. Они не очень каменисты, имеют хорошую структуру, удобны для глубокой обработки. Эти почвы пригодны для выращивания пшеницы и других требовательных к почвам культур. На юге и юго-востоке, где в рельефе преобладают песчанистые и суглинистые морены, почвы дерново-подзолистые.

Они нуждаются в известковании и в минерально-органических удобрениях, так как сильно выщелочены, бедны известью. Дерново подзолистые почвы хороши для выращивания льна. В холмистых районах возвышенностей Отепя и Ханья почвы сильно смытые, эродированные. Их трудно обрабатывать из-за того, что полевые угодья расположены на крутых склонах холмов. В бассейнах рек Пярну и Казари значительные территории заняты глеевымп почвами, сформировавшимися на ленточных глинах. Для освоения земель проводятся работы по осушению и регулированию водного режима.

В низинах больше половины земель занимают заболоченные и болотные почвы. Часть их используется под луга и пастбища. Распространены здесь также дерново-подзолистые и подзолистые почвы. Обработка земли затрудняется высоким уровнем грунтовых вод. В Эстонии имеются большие резервы земель, пригодных для пашни, культурных лугов и пастбищ, но они или заболочены, или покрыты валунами и кустарниками. Чтобы их использовать, земли приходится осушать, очищать от валунов и кустарников.