Издавна в Эстонии в большом почете был рыбный промысел. Крупные предприятия рыбной промышленности сосредоточены в Таллине и Пярну, где перерабатывается примерно 80% вылавливаемой рыбы. Остальная рыба поступает на мелкие предприятия, разбросанные по побережью. Помимо прибрежного лова все большее значение получает дальний лов в Северном и Норвежском морях, у берегов Канады, Африки. Свыше 2/з добываемой рыбы вылавливается в океанических водах. Особое внимание уделяется консервированию рыбы.

Эстонские кильки, шпроты, минога пользуются известностью. Сейчас в Эстонии добывается в среднем 200 тыс. т рыбы в год. Рыбаки только пярнуской рыболовной базы дают государству около 26 тыс. т рыбы в год — значительно больше, чем добывалось в Эстонии до 1940 г. Улов рыбы на душу населения самый высокий среди союзных республик и одни из самых высоких в мире. В прошлом технология переработки рыбы была примитивной.

Береговая перерабатывающая база представляла собой сеть мелких кустарных предприятий. Теперь построены крупные комбинаты (в Таллине, Пярну, Хаапсалу на истропах Сарема и Хпума), холодильники, рыбоконсервные заводы, механизированные рыбоприемные пункты. Рыбоперорабатыпающие предприятия нового Таллинского рыбного порта, строящегося специально для обслуживания экспедиционного рыбопромыслового флота, будут обрабатывать 3Д всей добычи.