Особенно быстро развивается переработка сельскохозяйственного сырья. В окрестностях города колхозы и совхозы специализируются в основном па свиноводстве и молочном животноводстве. Тарту вносит свои вклад в развитие животноводства. В Тарту находится Эстонский научно-исследовательский институт животноводства и ветеринарии, в котором изучаются вопросы племенного дела, проблемы рационального использования кормов, механизация работ по животноводству и т. д. За время своей деятельности (институт был основан в первые годы после Великой Отечественной войны) институт внес много ценного в практику животноводства.